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法国科学家绘制虹鳟鱼完整基因组刺果血桐

2022-07-28 20:51:59  学习农业网

法国科学家绘制虹鳟鱼完整基因组

法国科研人员最近完成了虹鳟鱼基因组的完整测序,并发现虹鳟鱼基因组较好地保留了1亿年前一次重要进化事件的遗迹,可以帮助了解脊椎动物的进化历程。

虹鳟鱼属鲑科,原产于北美洲太平洋沿岸。它肉质鲜美,在全世界被广泛养殖,同时也是被科学家研究最多的鱼类之一。

来自法国国家农学研究中心、国家基因测序中心等多家机构的科研人员在最新一期英国《自然—通讯》杂志上刊登了研究报告。这是科学界首次发布鲑科鱼类的完整基因组测序。

大约1亿年前,虹鳟鱼基因组经历了一次罕见的“全基因组倍增”,也就是整个基因组复制出一个副本的现象。全基因组倍增对生物进化有着深远影响,但大多数已知的这类事件非常古老,往往有2亿年到3亿年历史,留下的痕迹不明显。

虹鳟鱼的这次全基因组倍增发生得相对较晚,为深入研究这类现象提供了一个独特的机会。分析显示,经过1亿年的进化,虹鳟鱼基因组里的“原版”和“副本”仍非常相似。

科研人员说,这两部分不仅整体结构相似,还保存了许多基因,尤其是帮助调控基因表达的微RNA基因几乎全部保留了下来,与胚胎发育和神经突触发育有关的基因也保持了原始或近乎原始的样子。

这一研究结果证明,脊椎动物在发生全基因组倍增后,其基因组进化是一个缓慢渐进的过程。这推翻了此前被广泛认同的一个假设:全基因组倍增会引发基因组结构和基因构成的迅速进化。

新闻扩展:

科学家解密史前马基因组

在斯皮尔伯格导演的著名电影《侏罗纪公园》中,再现了史前动物。而日前由研究小组破译的约70万年前生活在加拿大地区的史前马的全基因组序列图谱,仿佛将马的进化历程重现于人们面前。

这是迄今为止破译的最古老的基因组,这项研究为包括远古人类在内的诸多已灭绝物种的基因组图谱绘制奠定了重要的遗传学基础。2003年,一个研究团队曾在加拿大育空领地蓟溪遗址古老的永久冻土层发现了冰封已久的马骨骼化石碎片,据今约有56-78万年的历史。通过初步的分析,该化石残存有一小部分胶原和血液。研究人员还发现,在过去的200万年间,马属种群发生了多次波动,特别是在气候剧变时期,多个冰期使得草原面积扩张,马的数量经历了一系列起伏。

对古DNA的测序仍然是一项极为挑战的工作,但是却能为解决一些关于近期物种演化、群体交流、人工驯化等争议问题提供新的有效解决手段。

中沙科学家联手绘制椰枣基因组图谱

中国和沙特科学家2013年12月8日在利雅得宣布,经过6年研究,他们已成功绘制了中东和北非地区主要农作物椰枣的基因组图谱。

沙特阿卜杜拉国王科技城主席穆罕默德在新闻发布会上说,椰枣基因组图谱的绘制将会对椰枣产量、品种改良和病虫害防治等产生重大影响。

2008年,沙特阿卜杜拉国王科技城投资2000万美元,与中国科学院北京基因组研究所合作,开始进行椰枣基因组研究计划。

椰枣树在中东北非地区广泛种植,是这一地区的主要农作物。其果实椰枣因其营养丰富、口味香甜而受到大众喜欢。据悉,全世界有2000多个椰枣品种,其中沙特就有450种之多。沙特椰枣产量相当于全球总产量的14%。

2010年,沙特阿卜杜拉国王科技城和中国深圳华大基因研究院合作,成功绘制出阿拉伯骆驼的基因图谱,这是世界上首次完成阿拉伯骆驼的基因破译。

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